​​不军训是否记入档案取决于是否履行请假程序：若经批准免训通常不记录，但无故缺席可能被记入档案并影响毕业​​。以下是具体分析：

1. ​​请假批准是关键​​：学生因身体原因等特殊情况向辅导员/班主任申请免训并获得书面同意后，高校或高中通常不会将缺勤记录归档。例如高中需提供医院证明，大学则需通过学校审批流程。

2. ​​无故缺席的后果​​：未请假直接不参加军训可能被记为“缺勤”或“拒训”，并载入学籍档案。教育部规定军训成绩为学籍档案必载项，部分高校可能因此延迟发放毕业证。

3. ​​教育阶段差异​​：高中军训管理相对宽松，个别学校允许补训；而大学军训作为国防教育必修环节，记录更严格，部分院校还会影响评优。

4. ​​长期影响有限性​​：即使被记入档案，多数情况下仅作为在校记录，对就业、考研等无直接影响，但可能影响校内评奖或保研资格。

​​建议​​：确需免训者应尽早提交证明材料办理手续，避免档案瑕疵。军训作为培养纪律性与国防意识的重要途径，鼓励有条件的学生积极参与。