程序员996工作制是否给加班费取决于企业合规性，但按《劳动法》规定必须支付且基数应为实际工资（含奖金补贴），否则违法。

1. 法律强制要求支付加班费
   我国《劳动法》明确规定，工作日加班需支付150%工资，休息日200%，法定节假日300%。企业若实行996（早9点至晚9点，每周6天），超出标准工时的部分均应按上述标准计算报酬。

2. 加班费基数不能“缩水”
   部分企业以“基本工资”为基数计算加班费属违法行为。法院判例显示，加班费应基于实际月均收入（含奖金、补贴等），例如杭州程序员胜诉追回9.8万元差额的案例。

3. **途径与现状矛盾
   尽管法律支持劳动者索要加班费，但现实中“996无补贴”现象普遍，部分企业通过“自愿加班”或模糊合同规避责任。劳动者可通过劳动仲裁或诉讼**，但需保留考勤、工资条等证据。

总结：程序员996的加班费并非企业“恩赐”，而是法定权益。若遭遇侵权，应积极运用法律武器，同时行业需推动合规文化以减少纠纷。