本科合并后，通过高校批次、专业录取分数线、学校层次和地域等因素来区分一本和二本。

本科合并后，高考招生中不再明确区分一本和二本，但考生和家长仍可以通过以下几点来判断学校的层次和定位：

1. 高校批次：虽然本科批次合并，但部分省份仍会公布高校的录取批次，作为参考。一般来说，传统意义上的一本高校会集中在提前批和本科批的靠前位置录取。

2. 专业录取分数线：不同学校的专业录取分数线会有所差异，传统意义上的一本高校的录取分数线通常较高。考生和家长可以通过查看近几年的专业录取分数线来判断学校的层次。

3. 学校层次：高校的层次可以通过其学科建设、师资力量、科研成果等多方面来判断。通常来说，211、985高校以及双一流建设高校属于一本层次，普通本科高校则属于二本层次。

4. 地域因素：不同地域的高校在录取分数线上也会有所差异。一般来说，位于经济发达地区的高校录取分数线较高，而位于经济欠发达地区的高校录取分数线相对较低。

5. 社会认可度：学校的知名度和社会认可度也是判断学校层次的重要因素。通常来说，传统意义上的一本高校在社会上具有较高的认可度和影响力。

通过以上几点，考生和家长可以在本科合并后区分一本和二本高校，从而更好地进行志愿填报和职业规划。也需要注意，随着高等教育的发展，学校的层次和定位也在不断变化，因此以上方法仅供参考。