九年一贯制学校通常不得开除学生，但仍可发放毕业证或肄业证。具体处理方式需依据地方教育政策和学生实际情况而定。

一、九年一贯制学校不得随意开除学生

根据《中华人民共和国义务教育法》和地方教育政策，九年一贯制学校在义务教育阶段不得以任何理由劝退或开除学生。这一规定旨在保障适龄儿童和少年接受完整义务教育的权利。

二、特殊情况下的处理方式

1. 严重不良行为：对于有严重不良行为的学生，学校和家长可向教育行政部门申请，将其转入专门学校继续接受教育，或采取其他帮教措施，确保完成九年义务教育。
2. 毕业或肄业证书：学生在义务教育阶段完成学业后，可按照学籍管理规定获得毕业证书；若未完成学业，但已满9年义务教育年限，则可颁发肄业证书。

三、地方政策差异

不同地区的教育政策可能存在一定差异。例如，部分地区明确规定学校不得开除学生，而另一些地区则可能对严重不良行为的学生采取特殊措施。具体操作需参考当地教育部门的规定。

四、建议与总结

若学生因特殊情况被处理，家长或监护人应主动与学校和教育部门沟通，了解政策依据和后续安排，确保学生的合法权益得到保障。九年一贯制学校开除学生的情况极为罕见，但相关政策明确保障学生完成义务教育的权利，同时也提供合理的学籍处理方式。