南京农业大学的专业目录涵盖多个学科领域，以下为2025年最新专业设置情况（综合多个权威来源整理）：
一、农学院
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本科专业 ：农学、种子科学与工程、智慧农业（全国首批特色方向：水稻遗传育种、数字农作技术）
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硕士/博士点 ：农学、作物遗传育种、农业信息学、植物保护、农业资源与环境等
二、工学院
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本科专业 ：农业机械化及其自动化、农业电气化、机械类、电子信息类、计算机科学与技术、人工智能、物联网工程等
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硕士/博士点 ：农业工程、机械工程、计算机科学与技术、电子信息工程、材料科学与工程等
三、植物保护学院
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本科专业 ：植物保护、农药学、生物信息学，特色方向：农业病虫害智能监测、转基因生物安全
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硕士/博士点 ：植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学、生物技术等
四、资源与环境科学学院
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本科专业 ：农业资源与环境、生态学、环境工程，特色方向：土壤修复、碳中和与农业绿色发展
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硕士/博士点 ：环境科学与工程、农业资源与环境、生态学、环境工程等
五、园艺学院
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本科专业 ：园艺、设施农业科学与工程、茶学，特色方向：观赏花卉育种、都市农业设计
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硕士/博士点 ：园林设计、茶学、观赏园艺学等
六、动物科技学院
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本科专业 ：动物科学、水产养殖学、动物医学（五年制），特色方向：畜禽智能化养殖、宠物疾病诊疗
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硕士/博士点 ：动物遗传育种与繁殖、动物营养与饲料、兽医临床医学等
七、食品与工程技术类
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本科专业 ：食品科学与工程、食品质量与安全、乳品工程，特色方向：功能性食品开发、食品安全区块链溯源
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硕士/博士点 ：食品科学与工程、农业工程、食品质量与安全等
八、经济管理学院
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本科专业 ：农业经济管理、国际经济与贸易、金融学，特色方向：农业经济管理、金融工程、农村与区域发展
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硕士/博士点 ：农业经济管理、金融学、工商管理、会计学等
九、其他学院
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外国语学院 ：英语、日语、法语等
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信息管理学院 ：计算机科学与技术、信息管理与信息系统等
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生命科学学院 ：生物学、生态学、微生物学等
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人文与社会发展学院 ：社会学、法学、公共管理学等
十、学科优势与特色
南京农业大学以农业和生命科学为优势，农学、动物医学、植物保护、农业资源与环境等学科进入全国前列。工科、理学、经济学等多学科协调发展，形成“农、理、经、管、工、文、法学”协同创新体系。
以上信息综合了2023-2025年最新招生专业目录及学科建设规划，具体以学校官方发布为准。