科目二坡起扣分原因主要包括以下几点：

1. 熄火：在坡道定点停车和起步过程中，如果车辆熄火，将被直接扣除100分。这通常发生在学员对离合器控制不当，导致车辆动力不足而熄火。

2. 溜车：在坡道起步时，如果车辆出现向后溜车的情况，也将被扣除100分。这主要是由于学员对刹车和离合器的配合不够熟练，导致车辆无法顺利起步。

3. 定点停车位置不准确：在坡道定点停车时，如果车辆停放的位置距离边线超过30厘米，将被扣除10分。如果距离边线超过50厘米，则将被扣除100分。这要求学员在停车时必须准确判断车辆与边线的距离。

4. 起步时间超时：在坡道起步时，如果学员在规定的时间内（通常为30秒）未能成功起步，将被扣除100分。这要求学员必须熟练掌握起步的要领，并能够在规定时间内完成起步操作。

5. 车身距离边线过宽：在坡道行驶过程中，如果车身距离边线超过50厘米，将被扣除100分。这要求学员在行驶过程中必须保持车辆的直线行驶，并准确判断车辆与边线的距离。

6. 压线：在坡道行驶过程中，如果车辆压到道路边缘线，将被扣除100分。这要求学员在行驶过程中必须保持车辆在正确的行驶轨迹上，避免压线的情况发生。

总结：科目二坡起扣分原因主要包括熄火、溜车、定点停车位置不准确、起步时间超时、车身距离边线过宽以及压线等。学员在练习和考试过程中应着重注意这些细节，以避免不必要的扣分。