科目二考挂5次，学员是有权协商退还科目三部分或全部费用的 。根据《机动车驾驶员培训管理规定》及《消费者权益保护法》，学员有权要求退还未产生的费用。具体退费金额需依据与驾校签订的培训合同中的条款以及已完成的培训项目、学时等因素来确定。

1. 查看合同条款 ：首先，学员应详细查阅与驾校签订的培训合同，特别是关于退费、违约责任等条款，以明确自己的权利与义务。

2. 协商退费 ：学员可以与驾校进行协商，尝试达成退费协议。如果协商无果，学员可以考虑通过法律途径解决。

3. 法律途径 ：若驾校拒绝退费或退费金额远低于预期，学员可以寻求律师的帮助，通过法律途径维护自己的权益。

需要注意的是，不同驾校的政策可能有所不同，具体退费情况还需参考驾校的实际规定。此外，如果学员在驾驶技能准考证明有效期内未能通过科目二和科目三的考试，已考试合格的其他科目成绩将作废，且需要重新报名和交费。

综上所述，虽然科目二考挂5次可能会影响退费金额，但学员仍有权要求退还科目三的部分或全部费用。建议先与驾校协商解决，协商不成时再考虑通过法律途径解决。