​​跨市分公司缴税需遵循"属地管理"原则，通常需在经营地预缴增值税（按2%-3%）、企业所得税（按0.1%-0.5%），同时汇总至总公司核算清缴。​​ 关键点包括：​​分支机构税务登记、税款分摊比例、跨区预缴时限及电子税务局操作​​。

1. 分公司需在成立30日内向经营地税务机关办理税务登记，获取独立纳税人识别号。跨市经营若涉及不同行政区（如省内不同地市），需按当地规定预缴增值税及附加税，例如建筑行业按项目收入的2%预缴。

2. 企业所得税实行"总分机构汇总纳税"，分公司按营业收入、职工薪酬、资产总额三因素分摊应缴税额，比例一般为0.1%-0.5%。季度终了15日内通过电子税务局完成《跨地区经营汇总纳税报告》。

3. 特殊行业如房地产、餐饮等可能需额外缴纳土地增值税或消费税。若分公司独立核算，需单独申报纳税；非独立核算则由总公司统一申报，但仍需完成经营地预缴义务。

跨市缴税需同步关注税收优惠备案（如西部大开发政策），逾期预缴将产生滞纳金。建议总公司与分支机构财务系统联网，确保数据实时同步。