安全员证书的颁发部门因证书类型和行业领域而异，常见的颁发部门和机构如下：

• 应急管理部门：对于危险化学品经营单位、矿山、金属冶炼单位和一般单位的安全员，其安全生产管理人员安全资格证通常由应急管理部门考核发证。省级安全生产监督管理部门负责省属生产经营单位和中央企业分公司、子公司及其所属单位的主要负责人和安全生产管理人员的考核发证；市级安全生产监督管理部门负责本行政区域内除中央企业、省属生产经营单位以外的其他生产经营单位的主要负责人和安全生产管理人员的考核发证。
• 住房和城乡建设委员会：在建筑施工领域，建筑工程安全员分三类，称为安全 “三类人员”，包括 A 本（企业负责人）、B 本（项目负责人）、C 本（专职安全员），这类安全员证书是由省（市）级建设委员会颁发的 “安全生产考核人员合格证书”。
• 中国建设教育协会：中国建设教育协会隶属住房和城乡建设部，是经民政部注册具有法人资格的国家一级社会团体。该协会颁发的安全员证书，是通过线上学习和线上考试获得的，在全国范围内具有一定的使用效力，可用于企业升级、招投标以及工程项目等方面，是建筑企业安全资质的必备证书之一。
• 人力资源和社会保障部门：安全生产职业资格证书通常由国家人力资源和社会保障部或其下属机构颁发，是国家对安全生产管理人员进行职业资格认证的重要凭证，具有较高的权威性和认可度。

一些大型企业会自行组织安全员培训和考试，并颁发企业内部的安全员证书，这种证书主要在企业内部使用。还有一些地方或行业协会也可能开展安全员的培训和证书颁发工作，但这种证书的认可范围可能相对较窄。