本科第二学位和双学位的区别主要体现在以下几个方面：
- 报考条件 ：
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双学位 ：主要招收本校全日制本科学生，从大二开始跨学科辅修另一个本科专业。报名条件是成绩较好，无不及格学科，以及满足各学校的其他要求。
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第二学位 ：主要招收大学本科毕业并获得学士学位的在职人员，也招收少量大学本科毕业获得学士学位的应届毕业生。在职人员报考要经本单位批准，并经过必要的资格审查与入学考试、考核，择优录取。
- 考试范围 ：
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双学位 ：考试由设立辅修二学位资格的高校单独出题、单独招生，没有全国统考。考试内容主要是第二学士学位专业的主要基础课程。
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第二学位 ：考试也由各招生高校单独出题、单独招生，没有全国统考。考试时间大约在每年的3、4月份，具体时间和考试科目各院校有所差异。
- 培养模式 ：
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双学位 ：教育属于本科教育的范畴，学生在学有余力的情况下，在主修一个本科专业之外，跨学科门类辅修另外一个本科专业。
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第二学位 ：着重培养国家急需的高级新兴专业人才，培养一批国家急需的知识面宽、跨学科的高层次专门人才。第二学士学位是经批准设立第二学士学位专业的高校，按照招生计划，经学校组织统一考试后录取进校学习的一种培养方式，学制二年。
- 毕业证书 ：
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双学位 ：毕业证书会在第一专业证书上注明辅修专业，或者由校方颁发辅修专业证书。
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第二学位 ：毕业证书和学位证书是分开的，由主考院校颁发。
- 审批权限 ：
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双学位 ：审批权限由学校自己制定批准。
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第二学位 ：需要教育部审批。只有教育部批准设置第二学士学位专业的高等学校才有权颁发第二学士学位证书。
- 含金量和社会认可度 ：
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双学位 ：含金量相对较低，一般按第一专业为主，辅修专业为辅，待遇等同于本科生。
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第二学位 ：含金量较高，受机关单位和大型企业认可，毕业待遇等同于研究生。
综上所述，本科第二学位和双学位在报考条件、考试范围、培养模式、毕业证书、审批权限以及含金量和社会认可度等方面都有明显的不同。考生在选择时应根据自己的实际情况和需求进行选择。