由于2000年以来的动画片数量庞大且持续更新，无法在此列出所有作品。以下为部分代表性作品分类整理，供参考：

一、日本动画经典

1. 《千与千寻》

   • 宫崎骏执导，获奥斯卡**动画长片、柏林金熊奖等多项荣誉，讲述少女在异世界的成长故事。

2. 《进击的巨人》

   • 被誉“人类史诗级动画”，描绘人类与巨人斗争的宏大叙事。

3. 《你的名字》

   • 以时空交错的为核心，获东京国际电影节**动画长片奖，探讨命运与记忆。

4. 《龙与虎》

   • 被评价为“治愈系日式动画代表作”，讲述掌中老虎与少年的成长故事。

二、国产动画热门

1. 《喜羊羊与灰太狼》

   • 中国经典动画，围绕羊族与灰太狼的斗智斗勇展开，长期占据电视黄金时段。

2. 《熊出没》

   • 以森林保护为主题，通过熊兄弟与光头强的互动传递环保理念。

3. 《海绵宝宝》

   • 陪伴多代人成长的美国经典动画，讲述海绵宝宝的奇妙冒险。

三、其他经典之作

• 《玩具总动员》系列

  • 皮克斯代表作，开创3D动画新范式，讲述玩具的拟人化故事。

• 《千与千寻》剧场版

  • 动画电影版，进一步扩大了影片的影响力。

• 《风起云涌的丛林冒险》

  • 《蜡笔小新》剧场版，经典角色与幽默剧情延续多年。

四、近年新作推荐

• 《你的名字》

  • 2016年上映，融合科幻与爱情，获多项国际奖项。

• 《进击的巨人》剧场版

  • 2018年推出，延续系列核心主题。

总结

以上仅为2000年以来动画片的冰山一角，涵盖日本、国产及国际经典。若需具体某类作品（如治愈系、科幻或儿童向），可进一步细化分类。