根据2025年的最新信息，计算机软件著作权申请的主要费用如下：

官方费用

1. 登记费：250元/件次。

2. 证书费：50元/件。

3. 其他可能费用：

   • 申请例外交存手续费：320元/件次。

   • 变更或补充登记费：150元/件次。

   • 请求延期处理费：第一次100元/件次，第二次200元/件次。

   • 软件源程序封存保管费：100页内120元，超过100页的，每增加一页增收2元。

代理费用

如果选择委托代理机构办理，代理费用通常在500元到2000元不等。具体费用会因代理机构的服务内容和加急需求而有所不同。例如，普通代理申请费用约为399元，而加急申请费用可能会更高。

注意事项

• 申请流程：包括注册账号、填写申请表、提交材料、邮寄纸质材料等。

• 审查时间：通常需要60个自然日，特殊情况可能会延长。

• 材料准备：需要提交软件源代码（前30页和后30页）、用户手册、软件功能描述等。

如果需要更详细的费用和流程信息，建议咨询中国版权保护中心或专业的代理机构。