本科和专科事业编的工资存在差异，主要体现在职级起点、工资构成及长期发展潜力等方面。具体差异如下：

1. 职级起点差异

   本科入编通常对应更高职级（如助理/科员），专科入编则多为员级（如办事员）。例如，专科学历对应5级薪级，本科学历对应7级薪级，薪级每提升一级，基本工资差异可达数十元。

2. 工资构成差异

   事业单位工资由岗位工资、职级工资、绩效奖金、福利津贴组成。本科因职级较高，基础工资（岗位+职级）普遍高于专科，但实际收入还受工龄、职称等因素影响。

3. 长期发展潜力

   本科在晋升时可能更具优势，尤其在竞争激烈岗位中，学历是重要考量因素。专科需通过优异表现弥补学历差距，晋升空间可能相对受限。

4. 地区与单位差异

   具体工资水平因地区政策、单位性质（管理岗/专技岗）而异。部分基层岗位专科与本科工资差异可能较小，但中高层管理岗或专业技术岗差异显著。

总结 ：本科事业编在初入职场时工资普遍高于专科，但长期发展需综合考量职级、能力及单位政策。建议结合个人实际情况选择，并关注目标单位的具体规定。