​​大股东持股超过90%意味着对公司拥有绝对控制权，能高效推动决策，但也可能引发治理失衡、中小股东权益受损等问题。​​

1. ​​决策效率与战略执行​​：大股东持股比例极高时，可快速统一意见并落实战略，避免因股权分散导致的决策僵局，尤其在市场变化或危机应对中优势显著。

2. ​​治理失衡与监督缺失​​：高度集中的股权可能削弱其他股东的制衡作用，导致决策缺乏多元化视角，甚至出现大股东滥用控制权损害公司利益的行为，如关联交易或利益输送。

3. ​​中小股东权益风险​​：中小股东话语权极弱，在分红、重大事项表决中易被边缘化，权益保障依赖法律救济途径，如股东诉讼或章程条款约束。

4. ​​市场与融资影响​​：股权流动性降低可能影响资本市场吸引力，外部投资者或因治理结构不透明而却步，限制公司融资渠道和发展空间。

​​总结​​：大股东持股超90%需平衡效率与制衡，通过完善治理机制、强化法律合规及中小股东保护，才能实现公司长期稳健发展。