财政国库库款管理存在以下主要问题，涵盖制度、人员、风险及操作等方面：

一、制度与监管滞后

1. 法规不适应改革需求

   现行《国家金库条例》及其实施细则制定于1985年，未及时修订以适应财税体制改革，导致管理依据滞后。

2. 处罚措施不力

   条例仅规定监督权，缺乏对虚增收入、资金流失等违规行为的明确处罚措施，执行难度大。

3. 职能定位模糊

   《中国人民银行法》和《预算法》未明确国库具体监管职能，导致实际操作中权限受限。

二、人员与机构配置不足

1. 人员素质参差不齐

   国库人员需同时掌握金融、财政、税务等多领域知识，但实际队伍素质难以满足业务发展需求，存在兼职现象影响工作质量。

2. 机构设置不合理

   人民银行县级机构改革后，国库与会计合并办公，人员不足导致内控机制失效，核算与监督难以有效落实。

三、资金利用效率低下

1. 闲置资金现象严重

   地方政府和企业缺乏合理投资计划，导致国库资金长期闲置，造成财政收益损失。

2. 资金与项目脱节

   国库资金与地方建设项目衔接不畅，未能充分发挥其支持作用。

四、支付与操作风险

1. 支付集中度低

   分散于多个环节（托管人、银行等），增加安全风险和财务管理难度。

2. 支付方式单一

   仍以现金和银行转账为主，缺乏第三方支付等现代化手段。

3. 操作透明度不足

   审核流程缺乏严格监督，易滋生腐败和操作失误。

五、现金管理局限性

1. 收益有限

   定期存款规模占政府存款比重不足2%，无法有效提升资金效益。

2. 波动熨平能力弱

   操作规模小、频率低，难以有效平衡政府存款波动。

总结 ：财政国库库款管理需完善制度法规、优化人员配置、提高资金利用效率，并加强支付系统建设与风险防控，以适应新时代财政管理需求。