代持股与直接持股的核心区别在于股权控制权、权利行使主体及风险承担方式，具体如下：

一、股权控制权

• 直接持股 ：实际出资人直接持有公司股份，享有表决权、分红权等股东权利，并能自主参与公司决策。

• 代持股 ：名义股东仅作为登记主体，实际控制权由实际出资人通过协议间接行使，需遵循代持人的指示操作。

二、权利行使主体

• 直接持股 ：由实际股东直接行使股东权利，决策流程依据公司章程和内部治理规定。

• 代持股 ：名义股东在工商登记中行使权利，但实际决策需通过代持协议执行，实际出资人通过协议间接影响公司事务。

三、风险承担方式

• 直接持股 ：实际股东按持股比例承担公司经营风险及收益。

• 代持股 ：实际出资人承担经营实质风险，名义股东若违反协议可能需承担违约责任，且代持关系可能因法律风险导致责任归属复杂。

四、法律性质

• 直接持股 ：基于公司法直接产生股东权益，具有明确的法律后果。

• 代持股 ：本质为委托合同关系，仅产生债权债务效力，无法直接产生公司法意义上的股东权益。

总结 ：直接持股是法定的股东关系，代持股则依赖合同约定实现间接控制，两者在法律地位、风险及操作复杂性上存在显著差异。