全日制本科和本科毕业证在学历层次和法律效力上是相同的，但在证书形式和颁发机构上存在差异。具体区别如下：

1. 学历层次与法律效力

   全日制本科和本科毕业证均代表同一学历层次，均为全日制本科学历，且均通过国家教育考试认证，法律效力完全一致。毕业生在公务员、研究生考试、司法考试等场景中享受同等待遇。

2. 证书形式与颁发机构

   • 全日制本科毕业证 ：由普通高等学校直接颁发，证书上加盖学校公章和校长印章，属于第一学历。

   • 自考本科毕业证 ：由高校与自考委员会联合颁发，证书上加盖省自考公章和院校公章，无校长印章，属于非全日制学历。

3. 适用场景与认可度

   两种证书在就业、职称评定、考研等场景中的认可度基本一致，均被用人单位和社会广泛接受。但全日制学历因学习形式规范，通常更受青睐。

总结 ：全日制本科和本科毕业证本质相同，区别仅在于证书形式和颁发机构。选择时需注意区分全日制学历与非全日制学历（如自考），但两者在学历价值上无本质差异。