农村土地承包经营权证漏登的处理流程可分为以下五个步骤，确保权益得到保障：

一、确认漏登原因

1. 测绘遗漏 ：若因土地未测到导致漏登，需提供承包合同、地块图纸等证据，申请重新测绘。

2. 权属争议 ：若存在相邻土地纠纷，需先解决争议，避免影响补登。

二、准备补登材料

需备齐以下三样材料：

1. 核心文件 ：土地承包合同原件（丢失可申请补办）；

2. 地块证明 ：承包地块清单（含名称、坐落、四至、面积）；

3. 身份材料 ：户口本、身份证及集体经济组织成员证明。

三、提交补登申请

1. 填写申请表 ：向乡（镇）农村经营管理部门领取《补登申请表》；

2. 免费测绘 ：部门安排专业机构补测土地，提前做好标记；

3. 公示审核 ：补测结果在村公示7天，无异议后进入下一步。

四、签订新合同与换证

1. 更新合同 ：与发包方签订补充承包合同或重新签订包含漏登地块的合同；

2. 换发新证 ：持审核材料至县级不动产登记中心换领新证，旧证作废。

五、注意事项

• 若涉及严重污损、遗失或权属争议，可同时向县级以上农业部门申请更正或补发；

• 补登过程中需配合实地核查，确保信息准确。

通过以上流程，可有效解决土地承包经营权证漏登问题，保障土地权益。