分公司增值税不可以与总公司一起缴纳。

在增值税的征收管理中，分公司作为独立的纳税主体，应当单独计算和缴纳增值税。根据《中华人民共和国增值税暂行条例》及其实施细则的规定，增值税的纳税义务人是在中国境内销售货物或者提供加工、修理修配劳务以及进口货物的单位和个人。分公司作为总公司的分支机构，虽然在法律上不具有独立的法人地位，但在税务上被视为独立的纳税人。

具体原因如下：

1. 纳税主体独立：分公司在增值税纳税上被视为独立的纳税主体，需要根据自身的销售额或应税劳务收入计算应缴纳的增值税。

2. 增值税专用发票管理：分公司在经营过程中开具的增值税专用发票，需要以自身名义进行开具和管理，不能与总公司的增值税专用发票混用。

3. 税务申报要求：分公司需要按照规定的期限和程序，向其所在地的税务机关进行增值税的纳税申报，不能与总公司合并申报。

4. 税收优惠政策：分公司可能享受不同的税收优惠政策，如小规模纳税人的优惠税率等，这些政策需要在分公司层面单独适用。

总结：

分公司的增值税不能与总公司一起缴纳，而是需要作为独立的纳税主体单独计算和缴纳。这符合增值税的纳税主体独立原则和税务管理要求。在实际操作中，企业应确保分公司的增值税纳税义务得到正确履行，避免因税务违规行为而受到处罚。