WPS目录更新不完全的原因可能包括以下几点：

1. 文件内容未保存：如果在WPS中对文档进行了修改但未及时保存，目录更新将无法反映这些更改。确保在进行目录更新前，已将所有修改保存到文档中。

2. 目录样式不匹配：WPS目录的生成基于文档中应用的标题样式。如果文档中的标题未正确应用样式，或者样式与目录设置不匹配，目录更新将无法正确识别和包含这些标题。

3. 文档结构复杂：对于包含大量章节、子章节或复杂层次结构的文档，WPS目录更新可能需要更长时间来处理和生成正确的目录。确保文档结构清晰，以便WPS能够更高效地更新目录。

4. 软件版本问题：不同版本的WPS可能存在不同的目录更新功能和性能。如果使用的WPS版本较旧或存在已知的目录更新问题，考虑升级到最新版本以获得更好的目录更新体验。

5. 插件或宏的影响：某些插件或宏可能会干扰WPS的目录更新功能。如果在文档中使用了插件或宏，尝试禁用它们以查看是否解决了目录更新不完全的问题。

6. 文件损坏或兼容性问题：文件损坏或与其他软件的兼容性问题也可能导致WPS目录更新不完全。尝试将文档另存为新文件或在不同设备上打开，以检查是否存在文件损坏或兼容性问题。

总结：WPS目录更新不完全可能是由多种因素引起的，包括文件保存状态、样式匹配、文档结构、软件版本、插件或宏的影响以及文件损坏或兼容性问题。通过逐一排查这些因素，可以找到并解决目录更新不完全的问题。