内蒙古自治区住房和城乡建设厅的主要部门包括：

1. 计划财务处

2. 城市建设处

3. 城市管理处

4. 城市执法监督局

5. 自治区城乡人居环境发展促进中心

6. 办公室

7. 人事处

8. 住房保障与公积金监管处

9. 房地产市场监管处

10. 小区与物业管理处

11. 机关党委

12. 离退休人员工作处

13. 自治区本级政府投资非经营性项目代建中心

14. 自治区住房和城乡建设厅综合保障中心

15. 自治区住房资金中心

16. 自治区建设工程招标投标服务中心

17. 自治区建设工程质量监督总站

18. 自治区建设工程造价管理总站

19. 自治区住房资金管理中心

20. 自治区建设工程社会保障费管理中心

21. 自治区建设科技推广中心

22. 内蒙古自治区住房和城乡建设信息中心

23. 内蒙古自治区住宅产业化促进中心

24. 内蒙古自治区机关事务服务中心

25. 内蒙古自治区城镇建设水文中心

26. 内蒙古自治区建筑节能监督管理中心

这些部门涵盖了从计划财务、城市建设、城市管理、行政执法监督、信息化建设和数字化应用，到住房保障、房地产市场监管、住房公积金管理、小区与物业管理等多个方面，构成了内蒙古自治区住房和城乡建设厅的完整工作体系。