科目二挂科是否扣教练钱，需根据具体情况分析，主要涉及以下方面：

一、教练是否直接扣钱？

1. 正常补考情况

   若学员补考科目二，通常无需直接支付补考费给教练。补考费一般由学员或驾校统一缴纳，教练可能通过后续教学服务收费或从学员总费用中分得。

2. 自行补考情况

   若学员自行在交管12123平台缴费并参加补考（不经过驾校或教练），则无需支付补考费，教练也不会因此获得额外报酬。

二、教练的收益影响

1. 提成减少

   科目二每挂科一次，教练的提成通常减少100元。例如，首次通过可获500元提成，挂科后补考通过则降至400元。

2. 极端情况

   若连续挂科（如5次），可能影响教练的后续教学安排，但教练一般不会因此被直接扣钱，仅损失未获得的提成。

三、其他注意事项

• 学员责任

  若因学员自身原因（如未参加练车）导致挂科，教练可能无法获得应得提成，但基本工资通常不受影响。

• 政策差异

  不同地区或驾校对补考费用的分担方式可能不同，建议提前与驾校确认。

综上，科目二挂科本身不会直接导致教练被扣钱，但会影响教练的提成收入。建议学员与教练或驾校沟通补考安排，以明确费用承担方式。