根据2024年新疆高考录取数据，2025年新疆高考540分左右（理科）可以报考的大学包括以下几所：
1. 中南大学
省份：湖南
批次：本科一批
2024年最低分：540分
2024年位次：2610名
简介：中南大学是“双一流”建设高校，以工科和医学见长，拥有多个国家级创新平台和重点实验室。
2. 南京邮电大学
省份：江苏
批次：本科一批
2024年最低分：540分
2024年位次：2610名
简介：南京邮电大学是国家“双一流”建设高校，以电子信息为特色，工科实力强劲。
3. 北京科技大学
省份：北京
批次：本科一批
2024年最低分：539分
2024年位次：2659名
简介：北京科技大学是教育部直属的全国重点大学，以工科为主，材料科学与工程、冶金工程等专业实力突出。
4. 北京交通大学
省份：北京
批次：本科一批
2024年最低分：537分
2024年位次：2768名
简介：北京交通大学是教育部直属的“双一流”建设高校，以交通运输、信息与通信工程为特色。
5. 湖南大学
省份：湖南
批次：本科一批
2024年最低分：536分
2024年位次：2830名
简介：湖南大学是“双一流”建设高校，以工科和理科见长，建筑学、土木工程等专业实力较强。
6. 中国农业大学
省份：北京
批次：本科一批
2024年最低分：536分
2024年位次：2830名
简介：中国农业大学是教育部直属的“双一流”建设高校，以农业科学、生命科学为特色。
7. 哈尔滨工程大学
省份：黑龙江
批次：本科一批
2024年最低分：536分
2024年位次：2830名
简介：哈尔滨工程大学是“双一流”建设高校，以船舶与海洋工程、核科学与技术为特色。
8. 深圳大学
省份：广东
批次：本科一批
2024年最低分：535分
2024年位次：2887名
简介：深圳大学是广东省重点建设高校，以计算机科学、电子信息工程等专业见长。
9. 山东大学（威海）
省份：山东
批次：本科一批
2024年最低分：532分
2024年位次：3054名
简介：山东大学（威海）是山东大学的重要组成部分，以海洋科学、电子信息等专业为特色。
10. 上海财经大学
省份：上海
批次：本科一批
2024年最低分：531分
2024年位次：3135名
简介：上海财经大学是教育部直属的“双一流”建设高校，以经济学、管理学为特色。
重要提醒：
位次比分数更重要：2025年新疆高考理科540分的考生，应重点关注自己的位次（全区排名），并结合近三年各大学的录取位次进行报考，避免直接参考分数。
专业选择：除了学校，还需关注各校的专业录取分数线，避免被调剂到不喜欢的专业。
如果需要更详细的院校和专业信息，可以参考相关来源或使用高考志愿填报工具进行模拟推荐。