南京建工集团破产的原因是多方面的，主要包括以下几个方面：

1. 1.房地产行业连锁反应：南京建工集团与恒大集团等房地产企业深度绑定，因房地产行业债务危机导致工程款被大规模拖欠。例如，南通三建被恒大拖欠工程款及商票约360亿元，直接导致其资金链断裂，陷入债务危机。类似的情况也出现在南京建工集团，导致其资金链紧张。
2. 2.过度依赖单一客户与行业：南京建工集团业务高度集中于房地产领域，缺乏多元化布局。这种过度依赖单一客户和行业的经营模式使得企业在房地产市场波动时抗风险能力极低。
3. 3.经营模式落后与成本压力：南京建工集团采用“垫资施工”模式，资金周转压力大，且行业利润率低。尽管年营收较高，但净利润微薄，叠加疫情导致的用工成本上升、原材料涨价等因素，最终难以维持运营。
4. 4.政策调控与行业转型滞后：国家对房地产市场的调控政策（如“三道红线”）加速了房企资金链断裂，连带建筑企业受损。同时，建筑行业向智能化、绿色化转型的趋势下，南京建工集团未能及时调整业务结构或技术升级，导致竞争力下降。
5. 5.法律风险与信用危机：南京建工集团因安全生产、票据逾期等问题频发，进一步加剧了经营困境。例如，南通二建因安全事故被多次处罚，并因票据逾期累计11.69亿元，信用评级大幅下调，融资渠道受阻。
6. 6.债务危机与资金链断裂：南京建工集团深陷债务危机，债务余额高达85亿元，涉及11只债券
7. 7.企业转型与经营不善：南京建工集团在转型过程中遇到一系列问题，导致流动资金出现困难，并逐渐衍化为集团整体债务困境

南京建工集团破产的原因是多方面的，包括房地产行业的影响、经营模式落后、政策调控、法律风险以及债务危机等因素。