运输公司安全经费的会计分录需根据费用性质和使用方式分情况处理，具体如下：

一、提取安全经费

1. 费用性支出 （如日常维护、安全培训等）

   借：管理费用—安全经费

   贷：专项储备—安全经费

2. 资本性支出 （如购置安全设备、建设安全设施等）

   借：在建工程

   应交税费—应交增值税（进项税额）

   贷：银行存款、应付职工薪酬

   固定资产达到预定可使用状态时：

   借：固定资产

   贷：在建工程

   借：专项储备

   贷：累计折旧

二、使用安全经费

1. 费用性支出 （如安全设备维修、安全检查等）

   直接冲减专项储备：

   借：专项储备

   贷：银行存款

2. 资本性支出 （形成固定资产）

   借：专项储备

   贷：累计折旧（固定资产后续不再计提折旧）

三、注意事项

• 计提依据 ：高危行业企业通常按营业收入的1.5%按月计提，计入相关成本或当期损益。

• 税务处理 ：提取的安全费用在税前不得扣除。

• 科目设置 ：需在资产负债表“所有者权益”项下设置“专项储备”科目。