零申报财务会计制度备案的填写流程主要包括以下步骤：

1. 登录电子税务局

登录电子税务局或前往主管税务机关办税服务厅。

2. 进入备案模块

在电子税务局中，选择【我要办税】模块，进入【综合信息报告】，找到【制度信息报告】或直接搜索“财务会计制度备案”。

3. 填写企业基本信息

在备案模块中，填写企业的基本信息，包括企业名称、统一社会信用代码、纳税人识别号等。

4. 选择“零申报”

在财务会计制度一栏，明确选择“零申报”，并详细描述零申报的原因和依据。例如，可以说明企业当期无应税收入或计税依据为零。

5. 核对信息并提交

核对填写内容，确保信息真实、完整。确认无误后，提交备案申请。

6. 注意事项

• 零申报不等于无需记账：企业仍需按规定建立账簿，妥善保管相关资料。
• 备案真实合规：提交的备案信息必须真实、完整，符合相关法规要求。

通过以上步骤，您可以顺利完成零申报财务会计制度备案。如有疑问，可咨询主管税务机关或登录电子税务局查看详细操作指南。