不一定违法

个税收入与实发工资是否违法，需结合具体情况判断，主要分为以下情形：

一、合法情形

1. 扣除项目差异

   个税计算以税前工资为基数，扣除社保、公积金等专项扣除及专项附加扣除后为应纳税所得额。若扣除项目设置合理，可能导致申报收入与实发工资存在差异。

2. 收入构成不同

   申报收入包含工资、奖金、津贴等应税项目，而实发工资仅指税后金额。例如单位代扣的水电费、房租等未实际发放但计入申报收入。

3. 税收优惠政策

   符合残疾人减征、地区性税收减免等政策时，实际缴纳税款可能减少，导致申报收入与实发工资差异。

二、违法情形

1. 虚报或隐瞒收入

   • 虚报收入 ：单位为少缴税款故意多列工资支出，或虚构业务增加成本。

   • 隐瞒收入 ：未申报劳务报酬、租金等应税收入，导致申报收入低于实际。

2. 违规扣除

   误将应税补贴（如交通补贴）作为免税项目处理，或长期不申报需纳税的补贴，均属违法行为。

三、法律后果

• 税务风险 ：长期差异且未合理解释可能引发税务稽查，面临补缴税款、滞纳金及罚款（罚款可达应扣未扣金额的50%-3倍）。

• 劳动纠纷 ：若涉及工资虚报，可能违反《劳动合同法》，导致劳动仲裁或诉讼。

四、建议处理方式

1. 自查与核对

   检查工资条、银行流水与申报记录，确认扣除项目及收入构成是否合规。

2. 沟通与纠正

   若发现单位错误，应及时与财务部门沟通，要求更正申报。

3. 专业咨询

   遇复杂情况可咨询税务师或劳动监察部门，避免因小失大。

个税与实发工资不符不必然违法，但需警惕单位违规操作。建议通过正规渠道核实差异原因，并依法维护自身权益。