医生辞职后被备案的处理方式需根据备案时间、执业状态及后续需求综合确定，具体如下：

一、备案后30日内办理退职注销

1. 备案时效要求

   医师辞职后，原单位或个人需在30日内向注册主管部门提交退职备案申请，提交材料包括辞职证明、身份证明等。

2. 注销注册情形

   若备案满2年且未继续执业，注册主管部门将自动注销医师资格；若需重新执业，需完成培训并重新注册。

二、执业中断处理

1. 重新执业条件

   若因备案导致执业中断超过2年，需在指定医疗机构参加3-6个月培训，培训合格后方可申请重新注册。

2. 变更执业地点

   若需变更注册地，需先办理注销备案，再向新注册地卫生部门提交申请，提供身份证明、原备案证明等材料。

三、特殊情况处理

1. 行政争议处理

   若因单位拒绝取消备案导致无法重新执业，可向当地卫健委投诉或通过法律途径**，要求依法处理。

2. 证件保管争议

   若医师资格证被原单位扣留，可向人社部门或卫生部门投诉，依据《医师法》规定，单位不得非法扣留医师证件。

四、注意事项

• 时效性 ：所有操作需在法定30日内完成，避免影响后续执业。

• 材料准备 ：备案或注销时需提供辞职证明、身份证明、原执业机构证明等文件。

建议优先通过官方渠道（如当地卫健委）咨询具体流程，确保操作合规。