农村合作医疗跨省报销最新流程如下，综合权威信息整理：

一、备案登记（关键步骤）

1. 线上备案

   通过「国家医保服务平台」APP或微信小程序，填写异地就医备案信息，选择就医地及类型（如长期居住、转诊转院），提交后等待审核。

2. 线下备案

   携带身份证、新农合医疗证到参保地医保经办机构办理，填写备案表并提交居住证或转诊证明等材料。

3. 急诊备案

   突发疾病可先就医，入院后3日内电话报备（保留通话记录），转诊单有效期3个月。

二、就医结算

1. 直接结算

   在已开通跨省直结的医院就医时，出示医保卡或电子凭证，费用由医保系统直接结算，患者仅需支付自付部分。

2. 垫付费用

   未开通直结的医院需先全额垫付，出院后1个月内携带材料回参保地报销。

三、报销材料

• 住院报销 ：身份证、新农合医疗证、住院发票、费用清单、出院小结、诊断证明。

• 门诊报销 ：医保卡、门诊发票、诊断证明（急诊需额外提供急诊证明）。

四、回参保地报销

1. 直接结算

   携带材料到参保地医保经办机构，15个工作日内完成审核并结算。

2. 委托代办

   若不便回参保地，可将材料寄委托他人办理。

五、注意事项

• 报销比例 ：乡镇卫生院/社区医院>三级医院，具体以实际政策为准。

• 时效性 ：转诊单有效期3个月，超期需重新备案。

以上流程综合了2025年最新政策，确保信息准确性和时效性。