可以同时缴纳农村合作医疗和职工医保，但需要注意以下几点：

1. 重复参保问题：根据国家医保政策，同一参保人在同一时间段内不得重复参加同一制度或不同制度的基本医疗保险。这意味着如果已经缴纳了职工医保，理论上不能再同时缴纳农村合作医疗。

2. 报销限制：即使同时缴纳两种医保，也无法同时享受两种医保的报销待遇。根据政策规定，参保人只能选择其中一种医保进行报销。

3. 如何选择：职工医保的报销比例和保障范围通常优于农村合作医疗，尤其是在重大疾病治疗方面。如果符合职工医保的参保条件，建议优先选择职工医保。

4. 特殊人群：对于灵活就业人员或未在用人单位参加职工医保的非全日制从业人员，可以选择参加职工医保，享受更高的报销比例。

5. 政策清理：如果已重复参保，建议联系医保部门进行清理，保留一种医保关系，避免不必要的麻烦。

农村合作医疗和职工医保可以同时缴纳，但无法同时报销，且职工医保的保障力度更大。如果符合条件，建议优先选择职工医保，并注意避免重复参保。