​​住院花费9000元时，新农合报销金额通常在3600元至6300元之间，具体取决于就医医院等级（乡镇卫生院报销比例最高可达70%，三级医院约40%）以及是否触发大病保险补充报销（超1万元部分可再报65%-70%）。​​

新农合报销金额的计算需综合以下因素：

1. ​​医院等级与起付线​​：乡镇卫生院起付线多为100-200元，报销比例60%-90%；县级医院起付线200-500元，报销比例40%-80%；三级医院起付线500-1000元，报销比例30%-60%。例如，9000元费用在乡镇卫生院扣除200元起付线后按70%报销可获6160元。
2. ​​合规费用范围​​：仅目录内药品、检查和治疗费用可报销。若9000元中含2000元自费项目，实际可报销基数为7000元，按40%比例仅报2800元。
3. ​​大病保险叠加​​：累计自付超1万元可触发二次报销。如9000元全为合规费用，县级医院报销4000元后自付5000元，若年内其他医疗支出达5000元，超1万元部分可按65%比例再报销。
4. ​​地区政策差异​​：部分经济发达地区乡镇卫生院报销比例可达90%（如北京大兴区），贫困人口或连续参保者还可额外提高5%-10%比例。

建议就医前咨询当地医保部门确认最新比例，优先选择基层医疗机构以提升报销额度，并保留完整票据以便大病保险追溯。实际报销时可通过医院“一站式”结算实时减免，避免后期手工报销的繁琐流程。