二学位退学确实会被记入档案，以下是详细说明及相关影响：

1. 是否记入档案

根据《普通高等学校学生管理规定》，学生申请退学后，学校会为其办理退学手续，并在学籍档案中记录相关信息。这些记录包括学籍注册信息、学年注册信息等。

2. 档案记录的内容

退学后，学籍档案中会明确标注学籍状态为“注销”，并记录退学的原因（如个人申请、政策调整等）。如果退学是主动申请，学校通常会发给“肄业证书”或“写实性学习证明”。

3. 对个人档案的影响

• 档案状态：退学记录会长期保留在个人档案中，通常由学校寄回户籍所在地的人才中心托管。
• 未来影响：退学记录可能会影响某些用人单位的背景审查。例如，部分公务员考试或国企招聘可能对学籍状态有严格要求，需要如实说明退学情况。

4. 处理建议

• 与学校沟通：在办理退学手续时，与学校明确档案的处理方式，确保后续档案能够顺利转交到户籍所在地的人才中心。
• 如实说明情况：在求职或参加考试时，若被问及退学原因，应如实说明，避免隐瞒可能带来的不利影响。

5. 参考政策文件

• 《普通高等学校学生管理规定》（教育部令第21号）明确规定了退学手续及档案处理的相关要求。

如有其他疑问，建议直接咨询学校相关部门或查阅相关政策文件以获取更准确的信息。