农村自建房“叫停”并非全面禁止，而是针对违规行为的规范管理。主要原因可归纳为以下四点：

1. 政策规范与安全监管

   国家通过“双不允许”（禁止城镇居民购买宅基地、禁止违规占用宅基地建房）和“一户一宅”政策，规范建房行为，严查未批先建、超面积建设等安全隐患。例如，2025年瑞金市一村民因占用耕地建房被****并罚款。

2. 土地资源保护与粮食安全

   无序建房侵占耕地，威胁粮食安全。通过统一规划管控，优化土地资源配置，避免资源浪费。例如，合村并镇、征迁项目暂停审批，防止新增建设用地。

3. 建设质量与基础设施协调

   乱搭乱建影响道路、排水等基础设施规划，且多起自建房倒塌暴露质量隐患。新规要求施工资质审核、三维建模等，提升房屋安全性。

4. 特殊情形下的动态管理

   仅对违规建房（如耕地建房、无证施工）实施叫停，证件齐全、符合政策（如“一户一宅”）的建房仍可正常办理。

政策核心是通过规范管理保障农民权益与农村可持续发展，而非限制合理住房需求。