​​总公司和分公司所得税合并申报的核心是“统一计算、分级管理、就地预缴、汇总清算”​​，适用于跨地区经营的非法人分支机构。​​关键亮点​​：①总公司合并所有分支机构利润统一计算税额；②税款按总机构50%+分支机构50%比例分摊；③分支机构仅需预缴，无需单独汇算清缴；④新设或撤销分支机构需及时调整分摊比例。

1. ​​政策依据与适用场景​​
   合并申报的法律基础是《跨地区经营汇总纳税企业得税征收管理办法》（2012年第57号公告），要求总分公司均为独立增值税纳税人但企业所得税汇总缴纳。分支机构需在当地预缴，总公司统一汇算清缴，避免重复征税或漏税风险。

2. ​​操作流程分阶段执行​​

   • ​​季度预缴​​：总公司计算全公司应纳税额后，填写《企业所得税汇总纳税分支构分配表》，分支机构按分配比例就地预缴。
   • ​​年度汇算​​：总公司合并全年数据计算最终税额，分支机构仅需提供财务报表等资料，不参与独立汇算。
   • ​​税款调整​​：多退少补由总公司统一处理，分支机构无需单独操作。

3. ​​分摊比例计算与争议解决​​
   分支机构分摊比例按营业收入（35%）、职工薪酬（35%）、资产总额（30%）加权计算。若地方税务机关要求独立纳税，需提供总公司出具的《汇总纳税证明》并引用57号公告第24条抗辩。

4. ​​特殊情形处理​​

   • ​​新设分支机构​​：成立30日内向总公司税务机关备案，调整分摊比例。
   • ​​分支机构注销​​：需重新计算分摊比例并移交完税证明。
   • ​​小微企业优惠​​：仅限总公司合并后整体符合标准时适用，分支机构不可单独享受。

​​提示​​：确保财务数据共享及时性，避免分摊比例错误或关联交易定价不公允引发的税务稽查风险。跨省经营企业建议提前与两地税务机关沟通备案要求。