分公司税务问题会牵连总公司，主要体现在税收责任和财务报表合并上。如果分公司未依法履行税务义务，如偷税漏税或未按时申报，总公司在某些情况下可能需要承担连带责任。

1. 分公司与总公司的税务责任划分

• 分公司作为非独立法人，其税务问题通常与总公司财务报表合并计算。如果分公司出现税务违法行为，例如未缴或少缴税款，可能会影响总公司的财务状况，并增加总公司的税务风险。
• 在中国，总分公司之间可能存在税收核定关联交易的风险，如果分公司存在税务问题，税务机关可能会对总公司展开税务稽查，进一步追究责任。

2. 税务问题牵连的法律依据

• 根据《中华人民共和国税收征收管理法》，税务机关有权对关联企业之间的税务问题进行联合检查。如果分公司未履行税务义务，总公司在特定情况下可能被要求承担补缴税款或滞纳金的责任。
• 涉税违法行为的牵连责任还可能涉及虚开发票等犯罪行为，总分公司之间的交易若被认定为虚假交易，可能面临更严重的法律后果。

3. 风险防范与应对措施

• 内部控制与合规管理：总公司应加强对分公司的财务和税务管理，确保分公司依法纳税，避免因分公司的税务问题而牵连自身。
• 定期审计与税务自查：通过定期审计和税务自查，及时发现并纠正分公司的税务问题，降低税务风险。
• 专业咨询与合作：寻求专业税务顾问的帮助，制定合规的税务管理策略，确保总分公司之间的税务合规性。

4. 总结与提示

分公司的税务问题确实可能牵连总公司，但通过强化内部控制、定期审计和专业咨询，可以显著降低这种风险。建议企业在设立分公司时，充分考虑税务合规性，避免因分公司的税务问题而影响总公司的经营和声誉。