当二级建造师遇到企业不配合注销注册时，可通过以下步骤**：

一、协商无果后的法律途径

1. 申请劳动仲裁或诉讼

   向企业所在地劳动仲裁部门提交仲裁申请，要求确认劳动关系解除。仲裁周期通常为45-60天，裁决书生效后即可作为合法证明。若企业恶意拖延，可同步向法院起诉，通过司法文书强制解除劳动关系。

2. 获取替代证明材料

   若企业拒绝出具离职证明，可通过劳动仲裁裁决书、法院判决书或调解书等法律文书作为替代材料。

二、强制注销流程

1. 提交申诉材料

   持身份证、劳动仲裁书/法院判决书、离职情况说明报告等材料，向省级住建厅注册中心提交《强制变更（注销）申请书》。

2. 等待审核与强制措施

   省级住建厅审核通过后，若企业7日内未提出异议，将强制注销其注册信息。注意需先通过系统提交注销申请，再通过申诉渠道启动强制流程。

三、注意事项

• 保留证据 ：离职时务必保留劳动合同、工资流水等材料，为仲裁或诉讼提供支持。

• 时间节点 ：原单位逾期未配合时，需在系统申报注销后7日内通过申诉渠道操作，否则可能影响注销进度。

• 证书处理 ：强制注销后需重新考取证书，但无需再考《建设工程项目管理专业职业资格》。

通过以上步骤，可依法维护二级建造师的合法权益并完成注销手续。