总价合同在结算时允许扣减的情况主要涉及以下情形，需结合合同条款和实际情况综合判断：

一、设计变更导致的工程量调整

1. 实际工程量减少

   若实际完成的工程量少于合同约定的工程量，且减少部分属于设计变更（如业主需求调整），则需从合同总价中扣减未施工部分的价格。

   • 例如：设计图纸减少钢筋用量，实际施工时按图纸完成，则需按比例扣减钢筋费用。

2. 实际工程量增加

   若实际工程量增加且属于设计变更（如新增功能模块），则需增加对应工程量的费用，总价保持不变。

二、未施工或不符合要求的工程部分

1. 未施工项目

   对于合同范围内明确标注但未实际施工的项目，通常允许从总价中扣减费用。

   • 例如：清单中包含的装饰工程未完成，则需扣减相应费用。

2. 未按图纸施工

   若实际施工未遵循设计图纸（如材料规格不符、工程量计算错误等），需根据实际情况调整工程量或进行设计变更扣减。

三、其他特殊情况

• 工程量清单错误

  若因编制错误导致清单量与实际量偏差，需根据合同约定处理。一般情况下，清单过量不调整，但承包方可通过其他项目抵扣。

• 合同条款约定

  部分合同可能明确约定未实施项目或设计优化导致的费用扣除规则，需严格依约执行。

四、结算审计的依据

结算审计时，需结合合同条款、工程变更记录、实际施工情况等多方面证据，判断是否属于可扣减情形。若合同未明确约定，则需参考行业惯例或法律法规（如《民法典》第四百九十条）。

总价合同允许扣减的核心在于“设计变更”和“未施工/不符合要求”，但需以合同约定为基础，并结合实际情况综合判断。