事业单位辞职未满5年是否需要支付违约金，需分情况讨论：

一、一般情况无需支付违约金

1. 非在编人员

   若属于无编制员工，与单位签订的服务期协议受《劳动法》约束，但违约金需以实际损失为限，且不得超过单位提供的培训费用。

2. 在编人员

   事业单位编制人员与单位签订的服务期协议不受《劳动法》调整，违约金需结合培训、岗位等因素综合判断，过高的约定可能被认定为无效。

二、需支付违约金的特殊情况

1. 专项培训协议

   若单位为员工提供了专项培训并签订服务期协议，员工违反约定需支付违约金，但金额不得超过培训费用及未履行服务期应分摊的费用。

2. 合同条款合法有效

   若服务期协议明确合法，且未违反《劳动法》强制性规定（如限制人身自由等），则需按约定执行。

三、法律依据与救济途径

1. 法律依据

   • 《劳动合同法》第二十二条：允许约定服务期及违约金，但违约金不得超过培训费用。

   • 《劳动法》第102条：违反保密或竞业限制等情形需赔偿损失。

2. 救济途径

   若单位要求支付违约金，可通过劳动仲裁主张经济补偿或要求返还培训费用。

四、注意事项

• 提前通知义务 ：无论是否支付违约金，均需提前30天书面通知单位。

• 协商与证据 ：双方可协商调整违约金金额，或通过工资调整、岗位调整等方式弥补损失。

总结 ：事业单位辞职未满5年是否支付违约金，主要取决于是否签订过专项培训协议及合同条款的合法性。建议保留相关协议、培训记录等证据，必要时通过法律途径维护权益。