​​查重系统不会自动收录用户的自查文章，但引用自己已发表的论文会被检测为重复（自引率）​​。关键在于查重系统的隐私保护机制和自引率的计算规则，合理引用需注意比例以避免学术风险。

查重系统通过比对数据库检测重复内容，但用户自查的论文通常不会被收录到公共库中。主流平台（如知网）明确承诺保密性，检测仅用于生成报告，不会二次传播或影响后续查重结果。若自查后未修改直接提交同一系统，可能因临时缓存触发重复提示，但更换系统或间隔一段时间后可避免此问题。

引用本人已发表论文需谨慎。系统会通过作者识别技术（如署名、单位）关联历史作品，计算自引率并计入总重复率。例如：直接复制自己已发表的实验数据或核心观点，若无规范引用格式，可能被判定为学术不端。建议通过改写表述、添加引用标注（如“参见本人前期研究[1]”）降低风险。

企业级查重系统与学术机构合作时，可能获得期刊已发表论文的授权库。这意味着用户投稿前自查若引用过自己的期刊论文，系统会优先匹配授权库内容而非临时检测记录。但这类合作通常有严格的数据隔离措施，不会因自查行为影响后续审稿。

自查安全但需规避缓存期，自引需规范标注。选择正规平台、分批检测、合理控制自引比例（建议＜10%），能有效平衡原创性核查与学术诚信。