公司要求员工上交毕业证原件是违法的，根据《劳动合同法》第九条明确规定，用人单位不得扣押劳动者证件或收取财物。关键点：①可拒绝上交并建议提供复印件；②若必须配合，需签订书面协议明确用途和归还时间；③遭遇侵权可向劳动部门投诉**。

分点论述：

1. 法律明确禁止
   任何公司以入职、存档等名义要求扣押毕业证原件均属违法，包括身份证、学位证等其他个人证件。劳动者有权拒绝，且无需承担任何违约责任。

2. 替代方案与风险防范
   若公司仅需核验真实性，可提供加盖公章的复印件，或配合原件现场查验后立即归还。若特殊情况下需短暂保管（如行业资质审核），必须签订协议，注明证件信息、保管期限及超期赔偿责任。

3. **途径
   若公司强制扣押或拒不归还，可携带劳动合同、沟通记录等证据向当地劳动监察大队投诉，用人单位将面临罚款（500-2000元/人）及赔偿损失等处罚。

总结：保护个人证件是法律赋予的权利，遇到不合理要求时需果断拒绝并留存证据，必要时通过法律途径维护自身权益。