‌小规模纳税人按1%税率开票时，需区分是否享受免税政策，通过价税分离确认收入与销项税额，并按实际减免金额结转营业外收入‌。以下是具体操作要点：

1. ‌收入确认与账务处理‌
   开具1%税率发票时，按价税分离原则记账：借记“银行存款/应收账款”（价税合计金额），贷记“主营业务收入”（不含税销售额）和“应交税费—应交增值税（销项税额）”（销售额×1%）。若季度销售额未超30万元，需将减免的增值税转入“营业外收入”。

2. ‌免税政策下的申报差异‌
   申报系统可能自动按3%税率计算免税额（如显示免税额为销售额×3%），但实际做账应依据政策允许的1%税率计算减免金额，确保账务与业务实质一致。例如：销售额20万元，账务按2000元（20万×1%）确认减免，而非系统显示的6000元。

3. ‌发票管理与科目设置‌
   开具发票时需在税控系统中选择1%税率，普通发票与专用发票处理方式相同。建议增设“应交税费—简易计税”科目专门核算1%税率业务，避免与3%税率混淆。

4. ‌税务申报与工具应用‌
   季度申报时，需在《增值税纳税申报表》中如实填写1%税率销售额及应纳税额。使用财务软件（如好会计）可自动生成分录并匹配申报数据，减少手工误差。

‌提示‌：政策可能调整，需定期关注税务动态；保留完整凭证以备核查，必要时咨询专业机构确保合规性。