贵港市委原书记李新元被查的原因可归纳为以下四点：

1. 长期贪腐行为

   2003年至2021年，李新元利用职务便利，在项目承揽、土地开发、工作调动等方面为他人谋取利益，收受贿赂折合人民币1.7亿余元。其受贿金额中，党的十八大后占比达97%。

2. 对抗组织审查

   在自治区纪委两次函询时，李新元拒不交代问题，甚至采取伪造证据、篡改口供等手段对抗审查，严重违反党纪国法。

3. 迷信与权色交易

   为改变升迁受阻的运势，李新元迷信风水，填平单位门前4000多平方米荷花池，并在公务接待中夹带私货，涉及权色、钱色交易。例如，以“合理公务接待”名义为亲属输送项目。

4. 虚假廉洁形象

   李新元表面装作廉洁自律，通过伪造假画（声称徐悲鸿真迹）套取2300万元，以及带头号召公职人员虚报“伙食费”掩盖违规吃喝，长期欺骗组织。

其贪腐行为触犯多项法律，最终在2021年12月被判处有期徒刑死缓，剥夺政治权利终身，并处没收个人全部财产。