农村合作医疗住院报销设有起付线，具体标准因医疗机构级别和地区政策而异。以下是主要报销规则：

1. 起付线设置

   • 一级医疗机构 ：起付线通常为100-200元（如乡镇卫生院100元，部分地区200元），起付线以下费用不予报销。

   • 二级医疗机构 ：起付线多为500元，起付线以上按比例报销（如60%）。

   • 三级医疗机构 ：部分政策不设起付线，或起付线较高（如700元），报销比例较低（如40%）。

2. 报销比例分段

   • 二级及以上医疗机构通常采用分段报销，例如：

     • 5000元以下部分按50%-60%报销；

     • 5000-10000元部分按55%-60%报销；

     • 10000元以上部分按60%-45%报销。3. 封顶线限制

   • 每年累计报销总额最高不超过4万元（部分地区可能为2万元）。4. 特殊政策说明

   • 尿毒症透析、癌症放疗等特殊门诊费用，按同级住院报销比例执行，每结算一次重新计算起付线。

建议 ：具体报销比例和起付线以当地政策为准，建议提前咨询当地医保部门或乡镇卫生院。