关于工程鉴定异议时鉴定费的承担问题，需根据诉讼阶段和责任方来判定，具体规则如下：

一、诉讼前单方委托鉴定

1. 费用承担原则

   由提出鉴定申请的一方先行垫付鉴定费用。

2. 后续承担方式

   • 若诉讼中败诉方被认定需承担责任，则由败诉方承担该费用；

   • 若双方均要求鉴定且协商一致，可各预付一半。

二、诉讼中委托鉴定

1. 一般情况

   鉴定费用由主张鉴定的当事人预交；

   • 败诉方承担费用；

   • 双方均要求鉴定时，通常各预付一半。

2. 特殊情形

   • 鉴定人因拒绝出庭或鉴定意见瑕疵需出庭时，其费用由申请方承担；

   • 法院委托鉴定且费用已包含在总费用中的，不再另行通知当事人垫付。

三、注意事项

1. 举证责任与费用关联

   当事人对鉴定材料有异议时，需在法院指定期限内提出，否则可能承担举证不能后果；

   • 鉴定意见不明确或存在瑕疵时，申请方需承担额外费用。

2. 合同约定的优先性

   若双方合同明确约定费用分担方式，则优先适用合同约定。

四、法律依据

• 《诉讼费用交纳办法》第二十九条 ：诉讼费用由败诉方负担，胜诉方自愿承担的除外；

• 《关于民事诉讼证据的若干规定》第三十九条 ：鉴定人出庭费用由败诉方负担，因鉴定意见瑕疵需出庭的由申请方承担。

工程鉴定异议时的鉴定费承担需结合诉讼阶段、责任方及合同约定综合判断，建议当事人在申请鉴定前与对方协商费用分担方式。