民房出租做厂房是否合法，主要取决于房屋的规划用途、是否经过相关部门审批以及是否符合相关法律法规。一般来说，如果民房未经过规划用途变更的审批程序，直接出租用作厂房，可能存在不合法的风险。

一、民房用途变更的法律规定

根据《民法典》第279条，业主不得违反法律、法规以及管理规约，将住宅改变为经营性用房。如果需要将民房改为厂房，必须经过有利害关系的业主一致同意，并依法办理规划用途变更手续。

二、实际操作中的合法性判断

1. 审批要求：民房改为厂房需要向当地规划和自然资源部门申请变更规划用途，并获得相关部门的批准。
2. 租赁合同效力：如果未经过审批，将民房直接出租用作厂房，可能导致租赁合同无效，甚至需要承担法律责任。

三、地方性政策的影响

不同地区可能有不同的地方性法规。例如，某些地区允许在特定条件下将民房改建为厂房，但需满足严格的审批条件和用途限制。具体合法性需结合当地政策判断。

四、建议

为避免法律风险，建议：

1. 咨询专业人士：在出租前，咨询律师或相关部门，了解具体法律要求。
2. 办理相关手续：确保民房用途变更符合法律和地方政策。
3. 明确租赁条款：在租赁合同中明确约定房屋用途，避免后续纠纷。

民房出租做厂房是否合法，需要结合房屋规划用途、审批程序以及地方政策进行综合判断。在操作前，务必咨询专业人士并办理必要手续，以确保合法合规。