山西省农科院自1958年成立以来，历经多次机构改革与领导更迭，​​现任党委书记为廖允成、院长为张强​​（2019年与山西农业大学合署后）。​​关键领导阶段包括：1959年首任院长武藻奠定科研基础、2019年合署改革后的赵春明与张强推动院校融合、2021年廖允成接任党委书记深化现代农业发展​​，历任领导在农业科研、技术推广和机构改革中均作出重要贡献。

1. ​​早期建设阶段（1958-1979年）​​
   首任院长武藻（1959年任职）组建综合性农业科研体系，设立粮作、棉作等六大研究系，并指导全省农业试验站工作。1979年更名为山西农业大学前，苗佩芳、伊铁石等领导推动科研与生产结合，奠定学科基础。

2. ​​改革与发展阶段（1980-2019年）​​
   郑友三（1980年代任院长）主导万家寨引黄工程，解决农业用水难题；刘惠民（2000年代任院长）强化技术推广，累计示范面积209万亩，新增经济效益9.02亿元。此阶段领导注重科技成果转化与生态农业建设。

3. ​​合署改革新时期（2019年至今）​​
   2019年与山西农业大学合署后，赵春明任首任校（院）长，整合资源推动“农科教”融合；2021年张强接任院长，廖允成任党委书记，重点发展智慧农业与乡村振兴，近年考察多地产业园区，深化政校企合作。

山西省农科院的历任领导始终围绕农业现代化需求，从基础科研到技术推广，再到跨领域改革，持续为山西农业高质量发展提供核心支撑。当前，合署后的山西农业大学（省农科院）正以更高效的机制服务区域农业创新。