​​员工累计迟到早退12次，企业应依据合法合规、循序渐进的原则处理：先核实考勤记录并书面警告，再结合制度采取扣薪、绩效处罚或调岗等措施，若屡教不改可解除劳动合同。关键点在于制度明确性、程序合法性及人性化沟通。​​

核实考勤数据是首要步骤，确保记录准确无误，排除系统误差或特殊情况（如突发疾病）。同时与员工面谈，了解迟到早退原因，区分主观懈怠与客观困难。

书面警告需明确违规事实、制度依据及后续后果，要求员工签字确认。若企业制度中规定“累计次数对应处罚阶梯”，可依规扣减薪资或取消季度奖金，但需注意扣除比例不超过法定标准。

对于多次违规且无正当理由者，可考虑调整岗位或工作时间，例如从弹性考勤转为固定坐班。若员工仍不改正，企业需留存完整证据链（如警告记录、谈话笔录），经工会或职工代表大会程序后依法解除劳动合同，避免违法裁员风险。

处理过程中需平衡制度刚性与管理温度，例如为通勤困难的员工提供弹性工时方案。最终目标是减少违规行为，而非单纯惩罚。