‌打卡9点零1秒是否算迟到，取决于公司考勤制度的具体规定‌。若制度明确以整点（如9:00）为截止时间，‌超时1秒即算迟到‌；若存在宽限期（如5分钟内不扣罚），则不算。‌打卡设备精度、制度条款的合理性及合法性‌是判断的核心依据。

‌1. 考勤制度是判定迟到的直接标准‌
多数企业会在员工手册或劳动合同中明确上下班时间及迟到标准。若规定“9:00前打卡”，则9:00:01属于迟到；若表述为“9:00到岗”，部分企业可能默认“9:00整”为最后期限。‌建议员工仔细阅读制度条款‌，避免因理解偏差引发纠纷。

‌2. 打卡设备精度影响时间判定‌
部分考勤系统记录时间精确到秒，而有些仅显示分钟。例如，某员工在9:00:59打卡，系统若四舍五入显示为9:01，可能导致争议。‌企业需提前告知打卡规则‌，并确保设备与制度要求匹配。

‌3. 宽限期是否合法合规‌
部分公司设置“弹性时间”（如5分钟缓冲期），但需注意两点：一是‌写入制度才具备约束力‌，二是‌超过宽限期后的处罚需符合劳动法‌。例如，扣减工资不得超过合理比例，且不能影响基本薪资。

‌4. 法律对迟到处罚的边界限制‌
根据劳动法，企业可对迟到行为制定奖惩规则，但‌处罚需合理且程序合法‌。例如，频繁迟到可扣绩效，但单次迟到1秒即扣全天工资可能被认定为无效条款。

员工应优先以公司制度为准，若对合理性存疑，可‌通过内部沟通或法律途径维护权益‌。企业则需确保制度透明、设备精准，并平衡人性化管理与纪律要求。