​​学科融合在教学实践中面临的关键问题包括教师观念误区、知识整合能力不足、课程资源匮乏、教学评价不完善及管理协调困难，这些因素直接影响着跨学科教学的效果与可持续性。​​

教师观念存在显著矛盾，部分教育者陷入"学科至上"或"去学科化"的两极思维，未能认识到学科基础与跨学科融合的协同作用，导致教学实践中出现方向性偏差。学科知识整合能力薄弱是另一大核心挑战，多数教师受限于传统分科培养模式，在跨学科主题设计中仅做表面知识嫁接，缺乏对学科思想、方法论及价值观的深度统整。

课程资源支撑体系尚未健全，多数学校缺乏系统性跨学科教学资源库，教材内容与项目需求存在脱节，数字化与实验设备等配套资源投入不足。教学评价机制无法适配跨学科特性，现有标准过度依赖单一学科成绩，忽视学生在项目式学习中的协作创新能力、过程性成长及问题解决能力培养。

在组织管理层面，多学科协作存在协调成本高、教师分工模糊、时间安排冲突等问题，同时跨区域校际合作机制缺位，导致优质资源共享困难。教师专业培训体系亟待完善，培训内容停留在理论宣导层面，缺乏指向真实教学场景的问题解决训练，教师知识更新速度难以匹配课程改革需求。

要突破现存困境，教育系统需构建协同机制，在理念共识基础上开发标准化教学框架与资源平台，优化教师能力认证与持续培养路径，建立过程性动态评价体系，并通过行政力量推动校际资源共享与管理协作，最终实现深度学科融合与核心素养培养目标。