根据相关政策和规定，咨询工程师和一级建造师可以同时注册在不同单位，但需要满足一定的条件。以下是详细说明：

1. 证书注册的基本原则

• 咨询工程师：由国家发展和改革委员会（发改委）负责管理，证书注册不受建设部相关规定的限制。
• 一级建造师：由住房和城乡建设部（建设部）负责管理，证书注册受到严格限制。

2. 是否可以同时注册

• 可以同时注册：如果咨询工程师证书的注册单位不属于建设部管理范围，那么它可以与一级建造师证书注册在不同的单位。例如，如果咨询工程师的注册单位是工程咨询单位，而一级建造师注册在施工单位，两者可以分开注册。
• 限制条件：如果咨询工程师的注册单位也属于建设部管理范围（如施工单位或设计单位），则根据建设部的规定，两个证书不能注册在不同的单位。

3. 政策依据

• 建设部规定：根据建设部发布的相关规定，所有由建设部颁发的证书（如一级建造师）只能注册在同一个单位。
• 咨询工程师证书管理：咨询工程师证书由国家发改委管理，其注册不受建设部规定的限制，因此可以注册在建设部管辖范围之外的单位。

4. 实际操作建议

• 在注册前，建议确认咨询工程师证书的注册单位是否属于建设部管理范围。
• 如果两个证书注册在不同的单位，务必确保咨询工程师证书的注册单位不与一级建造师证书的注册单位冲突。

总结

咨询工程师和一级建造师是否可以同时注册，取决于咨询工程师证书的注册单位是否属于建设部管理范围。如果属于不同管理范围，则可以分开注册；如果都属于建设部管理范围，则不能分开注册。在操作时，建议根据具体单位情况咨询相关部门或专业人士以确保合规。